随着国土资源大调查项目的实施，1999-2004年广州海洋局开展了南海永暑礁幅1:100万海洋区域地质调查“示范性图幅”的调查工作，编制了地形图、地貌图、地质图、构造图、矿产图等五种基础地质图件，19幅附图及相应编图说明书和调查成果报告。编制了《1:100万海洋区域地质调查规范》，并于2009年正式发布实施。
　　至2008年“海洋地质保障工程”的实施，加快了海洋区域地质调查工作步伐。目前南海已完成了所有1:100万图幅的调查，实现南海1:100万海洋区域地质调查全覆盖。同时，我局从2012年开始在我国重点经济区也相继开展了1:25万和1:5万的海洋区域地质调查工作。