重点实验室实行依托单位领导、学术委员会指导下的主任负责制。重点实验室主任的主要职责为：制定实验室发展规划和年度工作计划；组织制定实验室管理规章制度；贯彻执行学术委员会的决定；负责实验室的日常管理工作等。学术委员会是重点实验室的学术指导与审议机构，主要审议实验室的目标、研究方向、发展规划、重大学术活动、年度工作计划和年度总结；参与重要学术活动，指导学术研究；对重点实验室的发展、合作、开放提出意见和建议。

　　重点实验室自2012年批准成立十年以来，依托中国地质调查局广州海洋地质调查局，围绕“海洋权益、资源开发、持续发展”等国家重大需求，聚焦固体矿产地质、能源矿产地质、深部过程与多圈层资源环境效应、深海探测分析与地质大数据四大研究方向，在支撑我国海域天然气水合物两轮成功试采，太平洋富钴结壳、多金属结核和深海稀土资源，深水油气资源找矿突破方面取得了一系列标志性找矿突破成果和一批具有代表性和影响力的高水平科研成果，同时形成了以“海马”号、“海蜇”号为代表的深海探测技术体系，为维护国家能源资源安全、推动深海技术发展和服务地方经济建设做出了重要贡献。