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主要承担南海重点岛礁综合地质调查工作。承担南海重点岛礁生态地质、工程地质、灾害地质调查评价工作;承担南海岛礁资源环境承载能力和国土空间开发适宜性评价工作;承担南海岛礁淡水资源调查工作;承担岛礁相关重大科学问题、关键技术攻关工作;承担支撑三沙市自然资源管理相关工作。